MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 66580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016928	ATT	2	6	151	156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016928	AC	4	8	174	181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016928	AC	3	6	260	265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016928	TG	3	6	333	338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016928	GTC	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016928	ATTT	2	8	370	377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016928	TAA	2	6	410	415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016928	TTA	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016928	ATT	2	6	458	463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016928	GT	3	6	470	475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016928	AAGA	2	8	523	530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016928	TAT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
14	NC_016928	CAA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
15	NC_016928	TGT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019813
16	NC_016928	TAC	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019813
17	NC_016928	GAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
18	NC_016928	TAA	2	6	803	808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019813
19	NC_016928	ACA	2	6	831	836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
20	NC_016928	AAC	2	6	851	856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
21	NC_016928	AG	3	6	879	884	50 %	0 %	50 %	0 %	379019813
22	NC_016928	ATT	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
23	NC_016928	GGTT	2	8	1013	1020	0 %	50 %	50 %	0 %	379019813
24	NC_016928	ATGC	2	8	1038	1045	25 %	25 %	25 %	25 %	379019813
25	NC_016928	TCA	2	6	1052	1057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019813
26	NC_016928	ATA	2	6	1066	1071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019813
27	NC_016928	TTA	2	6	1123	1128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
28	NC_016928	TTA	2	6	1188	1193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
29	NC_016928	GAT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019813
30	NC_016928	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
31	NC_016928	AGA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
32	NC_016928	TTG	2	6	1366	1371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019813
33	NC_016928	CCA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019813
34	NC_016928	AGA	2	6	1414	1419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
35	NC_016928	GAA	3	9	1425	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
36	NC_016928	CCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019813
37	NC_016928	TA	3	6	1464	1469	50 %	50 %	0 %	0 %	379019813
38	NC_016928	CAAAT	2	10	1471	1480	60 %	20 %	0 %	20 %	379019813
39	NC_016928	ATT	2	6	1538	1543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
40	NC_016928	CTG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019813
41	NC_016928	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	379019813
42	NC_016928	A	7	7	1685	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	379019813
43	NC_016928	AG	3	6	1740	1745	50 %	0 %	50 %	0 %	379019813
44	NC_016928	GAA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
45	NC_016928	TGG	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019813
46	NC_016928	TCAT	2	8	1807	1814	25 %	50 %	0 %	25 %	379019813
47	NC_016928	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	379019813
48	NC_016928	AGA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
49	NC_016928	AAG	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
50	NC_016928	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016928	TAA	3	9	1946	1954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016928	T	6	6	1961	1966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016928	AC	3	6	2033	2038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016928	CCA	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016928	CTA	3	9	2114	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016928	TA	3	6	2142	2147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016928	TA	4	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016928	TAAT	2	8	2176	2183	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
59	NC_016928	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
60	NC_016928	TTA	2	6	2213	2218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
61	NC_016928	AAC	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019814
62	NC_016928	AGT	2	6	2406	2411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
63	NC_016928	TTG	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019814
64	NC_016928	A	7	7	2442	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	379019814
65	NC_016928	ATTA	2	8	2496	2503	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
66	NC_016928	AATTT	2	10	2519	2528	40 %	60 %	0 %	0 %	379019814
67	NC_016928	TTA	2	6	2557	2562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
68	NC_016928	CAATT	2	10	2585	2594	40 %	40 %	0 %	20 %	379019814
69	NC_016928	GACT	2	8	2718	2725	25 %	25 %	25 %	25 %	379019814
70	NC_016928	AGA	2	6	2757	2762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
71	NC_016928	TCA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019814
72	NC_016928	TAAA	2	8	2813	2820	75 %	25 %	0 %	0 %	379019814
73	NC_016928	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
74	NC_016928	TCT	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
75	NC_016928	TTTA	2	8	2874	2881	25 %	75 %	0 %	0 %	379019814
76	NC_016928	ATT	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
77	NC_016928	ACA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019814
78	NC_016928	AAATT	2	10	2963	2972	60 %	40 %	0 %	0 %	379019814
79	NC_016928	TTA	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
80	NC_016928	GGT	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019814
81	NC_016928	TGA	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
82	NC_016928	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019814
83	NC_016928	TCT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
84	NC_016928	AGA	2	6	3117	3122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
85	NC_016928	GGT	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019814
86	NC_016928	TTCA	2	8	3162	3169	25 %	50 %	0 %	25 %	379019814
87	NC_016928	AT	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
88	NC_016928	GATG	2	8	3183	3190	25 %	25 %	50 %	0 %	379019814
89	NC_016928	ATG	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
90	NC_016928	GTTGAA	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
91	NC_016928	TTC	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
92	NC_016928	GAC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019814
93	NC_016928	AATT	2	8	3287	3294	50 %	50 %	0 %	0 %	379019814
94	NC_016928	ATAAAT	2	12	3318	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016928	ATTA	2	8	3343	3350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016928	T	6	6	3366	3371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016928	GAAAA	2	10	3374	3383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016928	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016928	AATA	2	8	3453	3460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016928	CCAA	2	8	3469	3476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016928	AAT	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016928	GAG	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016928	AGA	2	6	3580	3585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019815
104	NC_016928	AT	3	6	3592	3597	50 %	50 %	0 %	0 %	379019815
105	NC_016928	A	7	7	3606	3612	100 %	0 %	0 %	0 %	379019815
106	NC_016928	GAAA	2	8	3643	3650	75 %	0 %	25 %	0 %	379019815
107	NC_016928	AGTA	2	8	3702	3709	50 %	25 %	25 %	0 %	379019815
108	NC_016928	ACC	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019815
109	NC_016928	ATC	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019815
110	NC_016928	TTG	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019815
111	NC_016928	AGT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019815
112	NC_016928	GTAG	2	8	3850	3857	25 %	25 %	50 %	0 %	379019815
113	NC_016928	A	6	6	3862	3867	100 %	0 %	0 %	0 %	379019815
114	NC_016928	GAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019815
115	NC_016928	GA	3	6	3956	3961	50 %	0 %	50 %	0 %	379019815
116	NC_016928	AGAA	2	8	3973	3980	75 %	0 %	25 %	0 %	379019815
117	NC_016928	A	6	6	3979	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	379019815
118	NC_016928	TAG	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016928	AAGG	2	8	4059	4066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016928	ACC	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016928	GGT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016928	AAT	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016928	TA	3	6	4137	4142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016928	AAAT	2	8	4143	4150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016928	TAA	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016928	TTTAAA	2	12	4238	4249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016928	A	6	6	4306	4311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016928	A	6	6	4332	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016928	AATT	2	8	4342	4349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016928	A	7	7	4398	4404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016928	AT	3	6	4411	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016928	ATT	2	6	4442	4447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016928	AAG	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019816
134	NC_016928	GTA	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019816
135	NC_016928	ATT	2	6	4511	4516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019816
136	NC_016928	TGG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019816
137	NC_016928	ATTA	2	8	4561	4568	50 %	50 %	0 %	0 %	379019816
138	NC_016928	TTCT	2	8	4651	4658	0 %	75 %	0 %	25 %	379019816
139	NC_016928	TCAT	2	8	4662	4669	25 %	50 %	0 %	25 %	379019816
140	NC_016928	ATG	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019817
141	NC_016928	A	6	6	4945	4950	100 %	0 %	0 %	0 %	379019817
142	NC_016928	AT	3	6	4998	5003	50 %	50 %	0 %	0 %	379019817
143	NC_016928	AGA	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019817
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383	NC_016928	ATA	2	6	14907	14912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_016928	GTAT	2	8	15362	15369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
400	NC_016928	TGT	2	6	15394	15399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_016928	TAT	2	6	15433	15438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_016928	T	6	6	15438	15443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_016928	TA	3	6	15450	15455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_016928	AGG	2	6	15471	15476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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